安慶籌建時期
1861年 咸豐十一年秋冬 歐陽兆熊、趙烈文謀劃重刻《船山遺書》、獲得曾國藩、曾國荃兄弟認可及支持。
1862年 同治元年 書局肇建工作正式啟動，訂立書局章程。
1863年 同治二年秋 曾國藩始招寫刻工匠、編校人員、購買板片。
1864年 同治三年五月 書局於安徽省安慶市兩江總督署軍械庫內正式創建，重刻《船山遺書》。
1864年 同治三年九月 清軍光復南京，書局隨遷至南京城南銅作坊，偽慕王府內。
金陵書局時期
1865年 同治四年六月 李鴻章以江蘇巡撫署理兩江總督，將書局遷至堂子巷，正式啟用金陵書局之名稱，始刻《四書十三經》。
1866年 同治五年十一月，曾國藩回督兩江，將書局遷至飛霞閣，親自校閱《船山遺書》並續刻《四史》。
1867年 同治六年春夏 《船山遺書》全帙刊竣。
1868年 同治七年十一月、馬新貽接任兩江總督，與崇文書局、浙江書局、江蘇書局、淮南書局合刻《二十四史》。
1870年 同治九年七月 馬新貽遇刺身亡，曾國藩回督兩江，始刻《十三經註疏》。
1871年 同治十年五月 與淮南書局合刻《毛詩註疏》。
1872年 同治十一年三月 曾國藩逝世，金陵書局進入後曾國藩時代。
1873年 同治十二年 李宗羲繼任兩江總督，始刻《欽定州縣規條》、《張子全書》、《司馬家範》、《大學衍義》、《上江志》等書。
江南書局時期
1876年 光緒二年書局更名為江南書局，「金陵書局」售稱繼續使用，形成「一局二名」的現狀。
1877年 光緒三年，江寧佈政使孫衣言撥款白銀三千兩，以解書局財政危機。
1878年 光緒四年，朝廷迭次降旨，諭令各地停止捐輸，裁撤局所，金陵書局遭受重大衝擊。
1884年 光緒十年，曾國荃繼任兩江總督。其間，金陵書局新刻書籍廿一種重刊四種。
1889年 光緒十五年，朝廷再次諭令各地裁撤局所，時任江督曾國荃上奏力保，並聯合戶部刊刻書籍十一種。
1890年 光緒十六年，曾國荃病逝於督署，劉坤一繼任江督。金陵書局鮮有建樹，名存實亡。
1898年 光緒廿四年四月廿三日，光緒皇帝頒布「明定國是」詔書，金陵書局改隸於江寧府衙，一切經費停止撥付，飛霞閣專儲書版，江南貢院售書処仍稱「江南書局」靠售賣書籍維持運轉。
江楚編譯局時期
1901年 光緒廿七年，朝廷實施「庚子新政」，成立江楚編譯局，金陵書局併入其中。
1911年 宣統三年，江楚編譯局併入江南圖書館，是為中國第一所公共圖書館。
民國時期
1912年 民國元年， 江南圖書館更名江南圖書局。
1913年 民國二年， 復更名江蘇省立圖書館。
1919年 民國八年，更名江蘇省立第一圖書館。
1927年 民國十六年，更名第四中山大學國學圖書館。
1928年 民國十七年，第四中山大學更名為國立中央大學，圖書館名亦隨之。
1929年 民國十八年，更名為江蘇省立國學圖書館。
1933年 民國廿二年，奉國民政府教育部令，拓建為國立中央圖書館。
1937年 民國廿六年，抗戰軍興，國立中央圖書館西遷重慶。
1945年 民國卅四年，抗戰勝利，圖書館隨國民政府還都南京。
1949年 民國卅八年，圖書館之一部隨國府播遷台灣。
新中國時期
1950年，奉中央文化部令，正名為國立南京圖書館。
1954年，更名為南京圖書館。
2006年，南京圖書館對社會公眾全面開放。
2021年，金陵書局復牌獨立運作，致力於大藏經編纂、校勘、訓詁以及漢學研究，重新走進公眾視野。